Soil Bacterial Community Diversity under Mangifera persiciformis in Guangxi
-
摘要: 2020年6月，以广西南宁市、崇左市扶绥县、百色市田阳区的原生天桃木Mangifera persiciformis为研究对象，采用PacBio第三代高通量测序技术，对天桃木土壤细菌群落多样性进行了研究，并通过测定土壤化学性质，分析天桃木土壤优势细菌群落与土壤化学因子的关系。结果表明：在门水平上，共存在23门细菌，其中变形菌门Proteobacteria和酸杆菌门Acidobacteriota是4个样地土壤的优势菌门；在属水平上，共鉴定出118属细菌，其中Vicinamibacter、疣微菌属Pedosphaera、硝化螺旋菌属Nitrospira为4个样地土壤的优势菌属；在种水平上，共鉴定出123种细菌，其中酸杆菌Vicinamibacter silvestris、疣微菌Pedosphaera parvula、芽单胞菌Gemmatimonas sp.、土生单胞菌Terrimonas sp.为4个样地土壤的优势菌种。冗余分析结果显示，土壤pH、速效K含量和有效P含量对细菌群落门水平和属水平组成影响较大，土壤pH、有效P含量、全P含量对细菌群落种水平组成影响较大。Abstract: In June 2020, 3 typical quadrats were established in 4 research areas in nature growing Mangifera persiciformis in Nanning, Chongzuo and Bose of Guangxi. Soil bacterial community under Mangifera persiciformis was determined by high-throughput sequencing technology, and the soil chemical properties were measured. The results showed that there were 23 phyla, of which Proteobacteria and Acidobacteriota was dominant in the four research areas. A total of 118 genera were identified, of which Vicinamibacter, Pedosphaera and Nitrospira was dominant in the four areas. There were 123 species were identified, of which Vicinamibacter silvestris, Pedosphaera parvula, Gemmatimonas sp. and Terrimona sp. were dominant. Redundancy analysis demonstrated that the available potassium, available phosphorus and pH had great influence on the composition of bacterial phylum and genus levels, and the total phosphorus, available phosphorus, and soil pH had great influence on the composition of species level.
-
-
[1] 纳小凡，郑国琦，彭励，等. 不同种植年限宁夏枸杞根际微生物多样性变化[J]. 土壤学报，2016，53（1）：241－250. [2] RAAIJMAKERS J M，PAULITZ T C，STEINBERG C，et al. The rhizo-sphere: a playground and battle eld for soilborne pathogens and benecial microorganisms[J]. Plant Soil，2009，321：341－361．
[3] 周文杰，吕德国，秦嗣军. 植物与根际微生物相互作用关系研究进展[J]. 吉林农业大学学报，2016，38（3）：253－260. [4] 广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所. 广西植物志·第三卷[M]. 广西：广西科学技术出版社，2011：443. [5] 冯廷星，李耀燕. 提高扁桃假植成活率技术初探[J]. 现代园艺，2019，9：67－68. [6] 黄旭光，陆炎松，李金华，等. 蒸腾抑制剂对扁桃水分利用效率及茎流速率的影响[J]. 西部林业科学，2019，48（6）：66－71. [7] 陆炎松，黄旭光，罗恩波，等. 不同生根剂对扁桃裸根苗的生根效果分析[J]. 林业与环境科学，2018，34（1）：54－58. [8] 鲍士旦. 土壤农化分析[M]. 北京：中国农业出版社，2000：30－107. [9] 刘璐，何寻阳，谢强，等. 桂西北喀斯特常见豆科植物根瘤菌的遗传多样性[J]. 应用生态学报，2015，26（12）：3663－3669． [10] 叶雯，李永春，喻卫武，等. 不同种植年限香榧根际土壤微生物多样性[J]. 应用生态学报，2018，29（11）：3783－3792. [11] YUAN Y L，SI G C，WANG J，et al. Bacterial community in alpine grasslands along an altitudinal gradient on the Tibetan Plateau[J]. FEMS Microbiol Ecol，2014，87（1）：121－132．
[12] 安然，马风云，崔浩然，等. 黄河三角洲刺槐臭椿混交林与纯林土壤细菌群落结构和多样性特征分析[J]. 生态学报，2019，39（21）： 7960－7967． [13] 黄巧云，林启美，徐建明. 土壤生物化学[M]. 北京：高等教育出版社，2015：279. [14] 贠娟莉，王艳芬，张洪勋. 好氧甲烷氧化菌生态学研究进展[J]. 生态学报，2013，33（21）：6774－6785． [15] O’CONNOR F M，BOUCHER O，GEDNEY N，et al. Possible role of wetlands, permafrost, and methane hydrates in the methane cycle under future climate change: A review[J]. Rev Geophys，2010，48（4）：RG4005.
[16] KISHIMOTO N，KOSAKO Y，TANO T. Acidobacterium capsulatum gen. Nov., sp. Nov. An acidophilic chemoorganotrophic bacterium containing menaquinone from acidic mineral environment[J].Cur Microbiol，1991，22：1－7．
[17] HIRAISHI A，KISHIMOTO N，KOSAKO Y，et al. Phylogenetic position of the menaquinone-containing acidophilic chemo-organotroph Acidobacterium capsulatum[J]. FEMS Microbiol Let，1995，132：91－94．
[18] BARNS SM，CAIN EC，SOMMERVILLE L，et al. Acidobactetia phylum sequences in uranium-contaminated subsurface sediments greatly expand the known diversity within the phylum[J]. App Environ Microbiol，2007，73：3113－3116．
[19] JONES R T，ROBESON M S，LAUBER C L，et al. A comprehensive survey of soil Acidobacterial diversity using pyrosequencing and clone library analyses[J]. ISME J，2009，3（4）：442－453．
[20] PANKRATOV T A，KIRSANOVA L A，KAPARULLINA E N，et al. Tel-matobacter bradus gen. Nov., sp. Nov., a cellulolytic facultative anaerobe from subdivision 1 of the Acidobacteria, and emended description of Acidobacterium capsulatum Kishim-oto et al. 1991[J]. Int J Syst Evolut Microbiol，2012，62：430－437．
[21] LU S P，GISCHKAT S，REICHE M，et al. Ecophysiology of Fe-cycling bacteria in acidic sediments[J]. App Environ Microbiol，2010，76： 8174－8183．
[22] RADAJEWSKI S，WEBSTER G，REAY D S，et al. Identification of active methylotroph populations in an acidic forest soil by stable-isotope probing[J]. Microbiology，2002，148：2331－2342．
[23] KATHARINA J H，ALICIA M G，GERHARD W，et al. The first representative of the globally widespread subdivision 6 Acidobacteria, Vicinamibacter silvestris gen. nov., sp. nov., isolated from subtropical savannah soil[J]. Int J Syst Evol Microbiol，2016，66（8）：2971－2979.
[24] WATSON S W，BOEK E，V A LOIS F W，et al. Nitrospira marina gen. Nov. Sp. Nov.: A chemolithotrophic nitrite-oxidizing bacterium[J]. Arch Microbiol，1986，144（1）：1－7．
[25] GENILLOUD O. Actinomycetes: still a source of novel antibiotics[J]. Nat Prod Rep，2017，34（10）：1203－1232.
[26] 习慧君，臧睿，刘闯，等. 河南黄河湿地放线菌多样性及植物病害生防放线菌的筛选[J]. 微生物学报，2019，59（4）：642－656. [27] ALBUQUERQUE L，FRAN?A L，RAINEY FA，et al. Gaiella occulta gen. nov., sp. nov., a novel representative of a deep branching phylogenetic lineage within the class Actinobacteria and proposal of Gaiellaceae fam. nov. and Gaiellales ord. nov[J]. Syst App Microbiol，2011，34：595－599.
[28] 金桃，冯强，万景旺，等. 五种根际促生菌在改善植物的农艺形状方面的应用：CN106472568B[P]. 2020－05－12. [29] 杨帆. 不同层次土壤中微生物群落对扰动和豆科植物生长的响应[D]. 咸阳：西北农林科技大学，2017. [30] 叶雯. 香榧根际土壤微生物多样性研究[D]. 杭州：浙江农林大学，2018. [31] 迪拉热·海米提，樊永红，王伟楠，等. 盐穗木叶片及根际土壤微生物群落高通量分析[J]. 新疆农业科学，2021，58（4）：731－740.
计量
- 文章访问数: 198
- HTML全文浏览量: 0
- PDF下载量: 239
下载:
